2009-07-01から1ヶ月間の記事一覧

Tools for large data analysis

多数のAffymetrixのアレイデータをNormalize (RMA, MAS5など)するためのパッケージ。 1.5Gbのメモリで1000枚のアレイを処理できるとあるが。(自分では未確認) xps aroma.affymetrix クラスタリングを高速、省メモリで実行するためのパッケージ amap & ctc …

Bioconductor Case Studies

DNAマイクロアレイのデータ解析本。 打ち込めば動くソースコードとともに使い方、解析の目的、結果の解釈を一通り学べる。 データの記述的な解析、QCについても詳しい。Bioconductor Case Studies (Use R!)作者: Florian Hahne,Wolfgang Huber,Robert Gentle…